Kebun Raya Batam terletak di Jalan Hang Lekiu, Kelurahan Sambau, Kecamatan Nongsa, Kota Batam. Lokasi obyek wisata ini sangat strategis karena dekat dengan Bandara Hang Nadim, Nuvasa Bay Batam, Pantai Nongsa Batam dan Pelabuhan Ferry Nongsapura. Lokasi ini juga merupakan daerah pariwisata dan pintu keluar masuk jalur internasional, terlebih negara-negara tetangga seperti Singapura dan Malaysia. Kebun Raya Batam dibangun diatas lahan seluas 86 hektar dan awalnya direncanakan sebagai lahan konservasi alam untuk menjaga setidaknya 58.57% luas daratan Pulau Batam yang merupakan hutan lindung.
Kebun Raya Batam telah menjadi rumah bagi berbagai jenis tanaman dan telah menjadi wisata yang populer bagi pengunjung lokal dan internasional. Jenis tanaman yang telah dilestarikan di kebun raya tersebut terdiri dari 28 famili, 140 genera, 2472 bedeng tumbuhan, dan 10.000 bibit tumbuhan lainnya.
Berdasarkan Perwako Nomor 22 Tahun 2014, UPT Kebun Raya Batam dirintis pada tanggal 28 April 2014. Kemudian pada tanggal 28 Agustus 2014, Menteri Pekerjaan Umum melakukan Peletakan batu pertama. Lalu pada tanggal 14 November 2017, Kebun Raya Batam diresmikan . Kemudian, Kepala Dinas Perumahan Rakyat Permukiman dan Pertamanan Kota Batam Bapak Eryudhy Apriadi mengatakan Kebun Raya Batam di Launching pada tanggal 22 December 2018, meskipun belum resmi namun sudah banyak pengunjung yang berdatangan